Para hacer limpieza del sistema, debes conocer las herramientas y cómo usarlas. Aún así Deepin permite hacer limpieza con ciertos datos con seguridad. En otros casos puedes usar aplicaciones de terceros cada cierto tiempo. Más detalles en el artículo de la wiki.
Limpieza por defecto
Por ejemplo, el Centro de control ofrece la opción de borrar la caché de las aplicaciones instladas o actualizadas. Cuya opción de limpieza viene activada por defecto.
Herramientas para hacer limpieza del sistema
En este caso tienes a Ubuntu Cleaner o BleachBit disponible en Deepin Store.
Recuerda que actúan como CCleaner en Microsoft Windows, con opciones más claras como caché, paquetes huérfanos y configuraciones obsoletas.